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Transfusionsmediziner arbeiten in Transfusionsinstituten oder Krankenhäusern oder auch in Gesundheitsämtern sowie Facharztpraxen. Viele Transfusionsmediziner sind im Bereich der medizinischen Forschung und Lehre tätig. Sie arbeiten sowohl in Laboren und Behandlungsräumen als auch in Büros. Die Lehrtätigkeit findet natürlich in Hörsälen oder Unterrichtsräumen statt. Transfusionsmediziner tragen u.a. die Verantwortung für Transfusionen in einem Krankenhaus oder angeschlossenem Klinikum. Auch die Leitung eines Fachbereichs wie beispielsweise dem der Immunhämatologie mit einem Blutdepot kann durch den Facharzt geleistet werden. Zu seinen Aufgaben kann auch die medizinische und organisatorische Weiterentwicklung sowie Mitgestaltung eines Transfusionsinstituts oder einer Transfusionseinrichtung gehören.